Вы давно знаете хозяев как адекватных, нормальных людей?
Они перед продажей не оставляли свое (уже Ваше) авто на сервисе для ТО или ремонта? там порядочный персонал?
если на все вопросы Вы ответили "да", то беспокоиться не стоит.
если же Вы не уверены, то:
"перепрограммирование" обычно сводится к тому, что нужно прописать заново брелки к сигналке в самой сигналке. Не знаю как в Вашей сигналке, но зачастую, если есть инструкция, то можно эту процедуру произвести самостоятельно.
сложнее с иммо - без спец. оборудования перешить ключи невозможно, поэтому, если есть опасения того, что третий ключ был прописан в системе, то лучше перешить заново, но процедура стоит денег.