Для неработающей машины пофиг как подключен аккумулятор. Просто принято так, что "минус" подсоединяют на массу, да и то из соображений снижения коррозии металла автомобиля. Это уже потом в схемах задействована электоника, которая пропускает ток в определенном направлении (в частности, генератор, вырабатывающий переменный ток, с помощью своего диодного моста преобразовывает его в постоянный ток и тогда именно на том проводе, который подключен к массе появляется именно "минус")