Ага. После поездки в Житомир два года назад заметил на 5 передаче легкий стук, исходящий где-то снизу, со стороны коробки, усиливающийся при торможении двигателем. Потом и на других передачах. Поехал на СТО, на подъемнике послушали, сказали первичный вал в коробке, ищите БУ коробку. Засомневался, слил масло с КПП, подергал дифференциал, закрутил на 3 зуба, вывешивал колеса,слушал- непонятно где стучит... Только когда вытащил приводы шрусов и покрутил правое переднее колесо, услышал перекатывающийся зуд- оказался ступичный подшипник, который меняли на СТО (1500 км прошел). Заменил сам и с тех пор езжу нормально. Так что все может быть, КПП напрасно мучил.
Перед подтягиванием лучше слить масло и подергать дифференциал, а то он притерся, а вы его подтянете, а потом отпустите без толку.