Протоколов может быть сколько угодно - а наказание действительно только одно (по самому тяжкому правонарушению).
По факту отсутствия документов (прав, техпаспорта) - полагаю, крыть нечем.
По факту отказа пройти освидетельствование - в протоколе мог написать что "не отказываюсь, настаиваю ехать в мед. заклад". Если написал - молодец, если не написал - сам себе хуже сделал. Слова к делу не пришьешь.
Владюха, свидетелем может быть КТО УГОДНО, заинтересованность решает только суд. И кстати ГСО и ГАИ 2 совершенно разные структуры, сам факт наличия у обоих формы и погон - заинтересованности не добавляет.